L’oncle de Sonoko Suzuki, Jirokichi, invite Conan, Kogoro, Ran, les détectives boys et le professeur Agasa dans le plus grand dirigeable du monde, le Bell Tree, où se trouve un diamant d’une valeur inestimable. Jirokichi veut une énième fois attraper le Kaito Kid. De nombreux terroriste sont à bord du vaisseau et projette d’injecter un poison mortel si leurs requêtes ne sont pas satisfaites. Conan et ses amis sont piégés, commence alors une bataille pour survivre ! Pourront-ils sortir de cette situation ? Conan devra alors coopérer avec le Kaito Kid pour sauver le dirigeable.