En 1580 au Japon, pendant la période Sengoku, le seigneur de guerre Oda Nobunaga mets le Japon à feu et à sang pour devenir le maître absolu. Les trois clans ninja, Kasumi, Hyuga et Hagakure, connus sous le nom de Shadow Warriors sont attaqués par les forces de Nobunaga. Seuls Ayame, Sakon et Ryoma, réchappent à la destruction de leur villages respectifs et se s’unissent contre Nobunaga. Ils ont en commun de posséder chacun une arme sacrée, transmise de génération en génération, et qui doit mette fin au mal selon la légende. Nobunaga, qui a fait pacte avec les forces occultes et qui contrôle les 7 ninja Oboro, les lances sur leurs traces afin de les éliminer. Mais alors que l’étau se resserre sur Nobunaga au château d’Azuchi, les ninjas découvrent que c’est Ranmaru, le conseiller de Nobunaga, qui en fait s’avère être le démon qui cherche à rouvrir une porte aux enfers en utilisant les armes sacrées.
