Un groupe de scientifiques mené par le Professeur Rondo accompagné de son fils Tori, est en pleine investigation sur la banquise quand une météorite s’écrase non loin de leur camp de base. Du cratère encore fumant émerge une silhouette : Deoxys. Apparaît alors le gardien des cieux Rayquaza. Quatre ans plus tard, Sacha et compagnie arrivent à Larousseville, une métropole à la pointe de la technologie. Sacha veut concourir à la Tour de Combat locale. C’est là qu’ils rencontrent Tori. Pendant ce temps, Deoxys les suit, mais pour quelle raison?
