Après le film Pretty Cure All Stars DX, les combats des Pretty Cure a été impressionné par les citoyens de Mirai de Yokohama, y comprise une étudiante nommé Ayumi Sakagami qui vient d’être transféré à l’école locale, mais sa personnalité introvertie l’emmène loin de la discussion des Pretty Cure avec d’autres personnes. Plus tard, elle se lie d’amitié avec une fée nommée Fu-chan, dont la véritable identité est Fusion qui était apparut dans le film Pretty Cure All Stars DX. Pour consoler Ayumi, Fusion décide de détruire de nouveau le monde, ce qui implique aussi les Pretty Cure à se rassembler et à se battre de nouveau à Yokohama.
